|
|
|
한국하천호수학회 / v.33, no.3, 2000년, pp.206-212 
|
반복염기 프라이머 PCR에 의해 탐색된 독성 남조류에 분포한 반복염기의 다양성
( Diversity of Repetitive Sequences in Toxigenic Cyanobacteria Detected by Repetitive Oligonucleotides-Primed PCR ) |
| 구정모;유순애;박상호;최창원; 배제대학교 생물학과, 바이오의약연구센터 PRC;배제대학교 생물학과, 바이오의약연구센터 PRC;배제대학교 생물학과, 바이오의약연구센터 PRC;배제대학교 생물학과, 바이오의약연구센터 PRC;
|
|
|
 |
|
| |
| 초 록 |
| 남조류 분리균주들은 주어진 배양조건에 따라서 특징적인 세포모양이 결핍되거나 형태가 변형되기 쉽기 때문에, 형태학적으로 종을 정확하게 구분하기 어렵다. 형태학적 지표대신에 단일 혹은 조합된 반복염기를 프라이머로 이용한 repetitive oligonucleotides-primed PCR (ROP-PCR)을 수행하여 담수계 오염을 일으키는 독성 남조류 Anabaena와 Oscillatoria 속의 구성원들의 DNA 밴드양상을 구별하였다. 그람음성 세균에 빈번하게 분포한 것으로 알려진 ERIC및 REP 반복염기, 남조류의 게놈으로부터 파생된 STRRIA와 LTRR 반복염기, 그리고 진핵생물의 반복염기를 이용하여 수행한 ROP-PCR은 남조류 분리균주들의 특이적이고 반복적인 DNA 지문 및 뚜렷한 유전형을 동정하게 하였다. 분리균주의 그룹분석은 ROP-PCR에 이용된 프라이머에 따라서 유의성있는 차이를 나타내었다. |
|
| Since some cyanobacterial isolates under selective culturing conditions are lacking of characteristic specialized cells or showing altered morphology, the morpho-taxonomic criteria are not accurate enough to discriminate between species. Instead of morphological parameters, a method based on the single or the combination of repetitive oligonucleotides in a single PCR, repetitive oligonucleotides-primed PCR (ROP-PCR), was applied to generate DNA profiles for members of the cyanobacterial genera Anabaena and Oscillatoria, both of which are responsible for causing poisonous blooms in various freshwater systems. ROP-PCR performed on 10 isolates of the cyanobacteria with ERIC and REP sequences from gram-negative bacteria, STRR1A and LTRR sequences derived from cyanobacterial genome, and eukaryotic repetitive sequences, led to the identification of distinct genotypes, and provided specific and repeatable DNA fingerprints for cyanobacterial isolates. Grouping analysis of cyanobacterial isolates showed a signifiant difference depending on the primer used in PCR. |
| |
| 키워드 |
| Morphological parameters;Anabaena;Oscillatoria;Repetitive oligonucleotides;ROP-PCR; |
| |
|
|
|
|
한국하천호수학회지 / v.33, no.3, 2000년, pp.206-212
한국하천호수학회
ISSN : 1976-8087
UCI : G100:I100-KOI(KISTI1.1003/JNL.JAKO200018317175948)
언어 : 영어 |
|
| 논문 제공 : KISTI 한국과학기술정보연구원 |
|
|
|
|
|
|
