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한국환경생물학회 / v.28, no.2, 2010년, pp.95-100 
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PBSA 분해효소 유전자의 분석
( Analysis of Gene Encoding the PBSA Degradation Enzyme ) |
| 주현진;김말남; 상명대학교 생물학과;상명대학교 생물학과;
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| 초 록 |
| 우리나라 토양으로부터 분리된 (주와 김 2009) poly (butylene succinate-co-butylene adipate; PBSA) 분해균 Burkholderia cepacia PBSA-7, Bacillus licheniformis PBSA-8 및 Burkholderia sp. PBSA-9에서 PBSA 분해효소를 암호화하는 유전자를 분석하였다. PCR을 수행하여 B.cepacia PBSA-7과 Burkholderia sp. PBSA-9는 약 1.5 Kb, B. licheniformis PBSA-8은 약 600 bp의 lipase 유전자(lip A) 절편을 가지는 것을 확인하였다. 세 균주 모두에서 유전자의 염기서열 내 lipase box인 Gly-X1-Ser-X2-Gly와 Ala-X1-Ser-X2-Gly가 존재하였다. B. cepacia PBSA-7의 PBSA 분해효소 유전자는 family I-1 lipases와 36~40%, family I-2 lipases와는 82~92%의 높은 유전적 상동성을 보였다. 또한 B. licheniformis PBSA-8의 PBSA 분해효소 유전자는 subfamily 1-4 lipases와 64~65%의 유전적 상동성을 나타내었으나, subfamily 1-5에 속하는 lipase들과는 거의 유전적 상동성이 없는 것으로 나타났다. Burkholderia sp. PBSA-9의 PBSA 분해효소 유전자도 family I-1 lipases와 35~37%, family I-2 lipases와는 83~94%로 높은 유전적 상동성을 보여 B. cepacia PBSA-7의 PBSA 분해효소 유전자와 유사한 결과를 보였다. |
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| Burkholderia cepacia PBSA-7, Bacillus licheniformis PBSA-8 and Burkholderia sp. PBSA-9 previously collected from Korea soil (Joo and Kim, 2009) were analyzed for the presence of genes encoding proteins operative in the degradation of poly(butylene succinate-co-butylene adipate; PBSA). Polymerase chain reaction analyses revealed a 1.5 kb fragment of the lipase gene (lip A) in B. cepacia PBSA-7 and Burkholderia sp. PBSA-9, while B. licheniformis PBSA-8 harbored the same gene fragment at 600 bp. The three strains possessed "Gly-X1-Ser-X2-Gly" and "Ala-X1-Ser-X2-Gly" lipase sequence regions. Burkholderia sp. PBSA-7 lip A displayed 36~40% homology with the family 1-1 lipases and 82~92% homology with the family 1-5. Burkholderia sp. PBSA-8 lip A was 64~65% homologous with the subfamily 1-4 lipases, but displayed no homology with the subfamily 1-5 lipases. Burkholderia sp. PBSA-9 lip A displayed 35~37% homology with the family I1 lipases and 83~94% homology with the family I2 lipases, similar to Burkholderia sp. PBSA-7. |
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| 키워드 |
| PBSA;degradation enzyme;Burkholderia cepacia;Bacillus licheniformis;Burkholderia sp.;Lipase;lip A;genetic homology; |
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환경생물 / v.28, no.2, 2010년, pp.95-100
한국환경생물학회
ISSN : 1226-9999
UCI : G100:I100-KOI(KISTI1.1003/JNL.JAKO201015441599755)
언어 : 한국어 |
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| 논문 제공 : KISTI 한국과학기술정보연구원 |
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